بخش مخزن کتابخانه مرکزی دانشگاه اصفهان: کتابهای فارسی در طبقه چهارم و کتابهای لاتین در طبقه¬ی پنجم کتابخانه قرار دارند. ورود به مخزن کلیه ی دانشجویان و اعضای هیئت علمی آزاد است و در صورت عدم مراجعه به مخزن باید درخواست کتاب خود را از طریق سیستم های جستجو واقع در طبقه همکف ثبت نمایند . منابع این کتابخانه شامل منابع چاپی و الکترونیکی است.
بخش مرجع و پایان نامه ها کتابخانه مرکزی دانشگاه اصفهان: در نیم طبقه‌ی بالایی، روبروی ورودی اصلی کتابخانه قرار گرفته است و همچنین راهی از ورودی حافظیه ساختمان مرکزی به این بخش تعبیه شده است. این بخش شامل منابع مرجع فارسی و لاتین و نیز پایان‌نامه‌های کارشناسی ارشد و دکتری ارائه شده در دانشگاه اصفهان می باشد. منابع مرجع و پایان نامه¬ها نیز امانت داده نمی‌شوند.
سالن مطالعه کتابخانه مرکزی دانشگاه اصفهان: در زیرزمین سمت راست بخش امانت کتابخانه قرار دارد. این بخش برای استفاده دانشجویان دانشگاه اصفهان است.
بخش اطلاع رسانی کتابخانه مرکزی دانشگاه اصفهان: در طبقه‌ی پنجم کتابخانه قرار دارد. این بخش آماده‌ی راهنمایی دانشجویان و کلیه اعضای کتابخانه برای استفاده از منابع کتابخانه دیجیتال و پایگاه‌های اطلاعاتی است. جهت اطلاع از کلیه ی خبرهای کتابخانه به پورتال مراجعه فرمایید. http://library.ui.ac.ir
بخش نسخ خطی کتابخانه مرکزی دانشگاه اصفهان: در زیر زمین واقع شده است. این مجموعه شامل اسناد، کتب نفیس، نسخ خطی، چاپ سنگی و کتب لاتین نایاب است. منابع این بخش به صورت الکترونیک نیز از طریق آدرس زیر قابل دسترسی است. www.sofeh.ui.ac.ir
بخش همکاری بین کتابخانه ای کتاب خانه مرکزی دانشگاه اصفهان: در حال حاضر در بخش امانت کتابخانه واقع در طبقه همکف کتابخانه مرکزی می باشد. خدمات این بخش مخصوص آن دسته از اعضای کتابخانه است که به منابع سایر دانشگاه ها نیاز دارند.
چگونه می توانیم کتاب امانت بگیریم؟ برای امانت گرفتن کتاب فقط از کارت دانشجویی بارکددار خود می توانید استفاده کنید. با این کارت از این کتابخانه و کتابخانه های دانشکده ای دانشگاه اصفهان می توانید کتاب امانت بگیرید. فعال کردن ایمیل شخصی در پنل کاربری جهت امانت کتاب اجباری می باشد. برای تمدید کتاب، از دو روز قبل از موعد بازگشت کتاب، با ورود به پنل کاربری خود در سامانه کتابخانه مراجعه کنید. در صورتی که کتاب شما رزرو شده باشد دیگر برای شما تمدید نخواهد شد و باید آنرا تحویل دهید.
نکته۱: در صورتی که کتاب شما تاخیر خورده باشد و بخواهید آن را تمدید کنید حتماً باید کتاب را همراه خود بیاورید.
نکته۲: برای رزرو کردن یک کتاب پس از جستجو در نرم افزار کتابخانه بر روی محل نگهداری مدرک مورد نظر بروید و کلیک کنید، سپس در قسمت بالا شماره عضویت خود را وارد کنید و گزینه رزرو را کلیک کنید. کتاب برای شما از موعد بازگشت آن تا ۴۸ ساعت رزرو خواهد شد.